较好双路服务器的搭建和系统准备
Setting up a High Quality Two-way Server and Preparing Its System
Jiawei Xu
Released: 2022-09-09 / Updated: 2022-09-09
1. 硬件配置
核心配件
CPU：2* XEON Platinum 8259CL正式版（24核48线程 主频2.5G 睿频3.5G）2*2800（淘宝）
散热器：2* 金钱豹LGA3647 散热器 2*118（淘宝）
主板：永擎EP2C621D12 WS（C621芯片组，集显） 3800（淘宝）
机械硬盘：西数HC550 WUH721816ALE6L4 16TB 7.2K SATA3氦气企业级硬盘 1518（淘宝）
固态硬盘：三星PM9A1 2TB 1280（闲鱼）
内存：12* 三星DDR4-2666 ECC REG 16GB 12*210+12（闲鱼）
电源：长城 猎金部落F10 1000W 白金全模电源 849（京东）
机箱：追风者614PC+3个14cm风扇 548（淘宝）
总价：16363
辅助配件
Redmi 215 NF 21.45英寸显示器 399（淘宝）
CSR-4.0 蓝牙适配器 30（淘宝）
Kali Linux免驱USB无线网卡 60（京东）
胜为 VGA线 1.8m 10（京东）
EWEADN 键鼠套装 86（京东）
16A-10A转换插座 8（街边五金店）
总价：593
2. 硬件安装
工具准备
普通十字螺丝刀
T30内六角梅花螺丝刀
小号活动扳手
散热硅酯
安装细节
该部分内容已经早先分享于计算化学公社论坛，见《较好双路服务器的硬件采购与组装细节分享》：http://bbs.keinsci.com/thread-31876-1-1.html
3. 系统准备
制作安装盘
我们将安装CentOS Stream 8。除此以外，Ubuntu 22等也是比较合适的选择。前往CentOS官网(https://www.centos.org)下载系统镜像，此处我们下载x86_64的.rpm源，文件大小约10 GB左右，下载到一个预先准备的空U盘中。下载Rufus用于制作系统盘(https://rufus.ie/zh/)，Rufus无需安装，下载后按照Rufus官网上罗列的步骤操作完成安装盘制作即可。
系统安装
将安装盘插入机箱上的USB接口，启动，按F12进入Boot界面。由于新机器未安装任何系统，因此会默认从安装盘开始安装系统。进入安装界面后，选择系统安装的位置，设置时区、root密码、用户名等即可，然后开始安装，安装完后重启即可。
安装常用库和软件
有些比较常用的库和软件可以先进行安装。在系统使用的初期，安装各种软件往往需要解决各种依赖问题，因此先安装一些常用的库有利于后续工作的开展。首先推荐安装一些初始化的包组，可以使用通配符进行安装：
sudo yum install bash-c*有时我们需要从Windows文件系统（即NTFS文件系统）获取文件，而Linux的ext4/ext6文件系统与之并不兼容，这时需要安装NTFS-3g包。首先用wget添加依赖源，可以使用阿里云的镜像，然后yum安装即可：
sudo wget -O /etc/yum.repos.d/epel.repo http://mirrors.aliyun.com/repo/epel-7.repo
sudo yum install ntfs-3g如果有NTFS文件系统的硬盘存在（如：/dev/sdb2），此时就可以用mount挂载了：
mount -t ntfs /dev/sdb2从Intel官网(https://www.intel.cn/content/www/cn/zh/homepage.html)下载Intel编译器全家桶，推荐下载Intel oneAPI Base Toolkit和Intel oneAPI HPC Toolkit两个包，包含了ifort编译器、MKL数学库等十分常用的内容。这两个包可以通过Online方式安装，只需要按照提示点几下鼠标即可，非常方便。注意HPC Toolkit是依赖于Base Toolkit的，因此先安装Base Toolkit，但即使顺序颠倒，HPC Toolkit安装助手也会要求先完成Base Toolkit安装后再进行。使用Online方式安装的Intel全家桶默认安装在/home/$Username/intel下，此时需要将相关路径写入.bashrc文件才能使编译器被自动调用。
安装gcc：
sudo yum install gcc从CMake官网(https://cmake.org/)下载安装CMake3.0以上版本，可用于各种常用软件的编译。
除此之外，VMD需要Tcl库，GROMACS需要fftw库，有些程序需要MPI并行，这些都需要另外安装。
* Deqing Yu from Fujian Institute of Research on the Structure of Matter provided valuable advice for this work.